Ως αυτοτελής και αποκεντρωμένη μονάδα η υπηρεσία "Βιβλιοθήκη και Κέντρο Πληροφόρησης" λειτουργεί σε επίπεδο Διεύθυνσης. Αποστολή της είναι η υποστήριξη και προώθηση του εκπαιδευτικού και ερευνητικού έργου των μελών της Ακαδημαϊκής Κοινότητας μέσω της ανάπτυξης, οργάνωσης διατήρησης συλλογών αλλά και μέσω της εξασφάλισης πρόσβασης σε πηγές πληροφόρησης που βρίσκονται σε άλλες Βιβλιοθήκες ή οργανισμούς.
Παράλληλα, η Βιβλιοθήκη αποσκοπεί στην υποστήριξη του επιστημονικού έργου του ευρύτερου κοινωνικού συνόλου των νησιών, όπου εδρεύουν Σχολές και Τμήματα του Ιδρύματος, και στην προαγωγή και διάσωση του πολιτιστικού αποθέματος του Αιγιακού χώρου.
Η Βιβλιοθήκη από διοικητικής απόψεως διαρθρώνεται στην Κεντρική Υπηρεσία αποτελούμενη από δύο Τμήματα και έδρα την Μυτιλήνη και στα Παραρτήματα Βιβλιοθήκης που εδρεύουν στα νησιά Μυτιλήνη, Χίο, Σάμο, Λήμνο, Σύρο και Ρόδο και είναι επιφορτισμένα με την υποστήριξη των εκπαιδευτικών και ερευνητικών αναγκών των αντίστοιχων ακαδημαϊκών μονάδων.
